Les molécules organiques peuvent être formés par l'activité biologique d'un organisme (tel que le méthane émis par les systèmes digestifs des vaches ou des composés organiques) peut simplement avoir une base de carbone, tel que le benzène (un composé dans le pétrole). Il existe quatre classes d'hydrocarbures. Celles-ci se différencient par le type de liaison des électrons entre les atomes de carbone. les molécules d'hydrocarbures peut contenir des atomes de carbone qui ont des liaisons simples (alcanes), doubles liaisons (alcènes), des triples liaisons (ou d'alcynes). La classe d'hydrocarbures appelé "isomères" peut avoir la même formule chimique, mais peut être restructuré de différentes manières. Les molécules organiques deviennent progressivement plus complexe que d'autres éléments, tels que l'azote, le soufre et le phosphore, sont inclus.