En 2009, des chercheurs de l'Institut J. Craig Venter et de l'Université du Wisconsin a publié les génomes de tous les 99 souches de rhinovirus humain. Ils ont utilisé les données de cet effort de démêler les relations entre les différentes souches, construire un arbre de la famille et d'essayer d'éclairer l'histoire de rhinovirus humain. Bien qu'il ait été précédemment pense qu'il y avait trois espèces de rhinovirus humain, à savoir VRC-A, B et HRV-VRC-C, les données de l'étude de 2009 ont suggéré l'existence d'un quatrième, HRV-D. Il a également suggéré que le VRC-souches A et HRV-C ont partagé un ancêtre commun et étaient étroitement liés au groupe HRV-B. VRC sont le plus étroitement liés à entérovirus humains (HEV), qui sont des virus qui infectent principalement le tractus gastro-intestinal. À l'heure actuelle, on estime que les VRC partagent un ancêtre commun avec les véhicules électriques hybrides et que HRV-B est plus étroitement lié à HEV que les autres, bien que quand chaque espèce ont divergé est pas connue.