Sauf contaminants dans les eaux usées sont éliminés ou traités suffisamment, ils peuvent causer des perturbations de la membrane ou de brancher. Technologies de prétraitement, qui sont cruciaux pour l'efficacité du procédé d'osmose inverse, incluent conditionné pour ajuster le pH des eaux usées et pour empêcher la membrane de brancher des précipitations de sel. Prétraitement filtration - ultrafiltration, microfiltration, filtration sur charbon actif ou des cartouches filtrantes - empêche le colmatage des impuretés en suspension. Le type choisi dépend des caractéristiques des déchets et les niveaux de pureté souhaité. Autres procédés de prétraitement, tels que la clarification, adoucissantes avec des échangeurs d'ions, la chloration ou dé-chloration, peuvent également être utilisés, selon les besoins et l'utilisation finale.