Aucune écosystème est entièrement libre de sédiments. Dans les milieux aquatiques, sa présence peut menacer la santé des écosystèmes. Les sédiments peuvent brouiller l'eau, qui à son tour peut avoir un impact négatif sur les plantes et les animaux de ces lieux. En outre, selon le type de sédiment, d'autres problèmes peuvent également se produire. Il peut avoir des sources à la fois organiques et inorganiques, que ce soit les algues flottant dans l'eau ou des particules de sol suspendu à partir d'un rivage érodé.