Un hiver avec des journées fréquents de températures sous zéro et peu de neige peut être dur sur un système septique. Sans l'isolation d'un manteau de neige, l'eau peut geler dans les tuyaux menant vers et depuis le réservoir, et il peut aussi congeler dans le domaine de vidange. Il faut généralement une aide professionnelle pour dégeler un système congelés, il est donc préférable de prendre des mesures pour l'empêcher de geler en premier lieu.